Le portail web Galaxy

Le portail web Galaxy@DATARMOR permet de charger des données de séquences sur DATARMOR et propose un ensemble d'outils pour :

• manipuler les fichiers de séquences,
• assembler les données de séquençage,
• annoter les gènes et protéines prédites (par recherche d'homologies, alignement de séquences ou construction d'arbres phylogénétiques),
• analyser des données de transcriptomes.

A chaque outil correspond un formulaire permettant à l'utilisateur de configurer son programme (données d'entrée, paramètres).

La soumission du formulaire génère les lignes de commandes qui sont exécutées sur DATARMOR. Les fichiers de résultats sont visualisables ou téléchargeables directement dans le portail.